生物工程实验室主要是对化学生物进行科学研究，因为涉及到化学试剂，在一个密封的空间里，所以生物工程实验室设计是一定要配备通风系统的。通风系统把实验室中的有害气体排出室外，保障了环境的洁净度和工作人员的人身安全。
1.生物工程室内设施的基本要求
一般设药品仪器室、生化室、办公室，根据生物工程实验室设计装修要求设置通风系统、水电系统、照明、电源插座、总电源控制、温湿度等实验室设计。实验台、通风柜要求水、电到位，设有220V 的二孔、三孔插座各二个以上，实验员办公室远离化学实验室。
2.药品仪器室
实验室设置要做好防火、防潮，危险的化学品应独立一个存放位置，生物工程实验室设计中要求配备防护设备和急救箱，室内要有通风设置，例如在实验台上方配置原子吸收罩或万向抽气罩，这样在实验台上操作试验时方便把气体排放出去，不影响室内的环境。
3.实验室家具
实验台外观整洁，实验台上的水盆的水管不外露，台面可装有水龙头及PP水槽、洗眼器、滴水架等实验室设施，实验台上还应有电源保护装置，符合科学、实用化。
生物工程实验室是研究分子识别为基础进行生物识别及免疫分析的实验。因此在前期的生物工程实验室设计中，要符合实验室标准要求。
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